Qu'est-ce que le microbiote

Des milliards d'organismes, en particulier des bactéries, peuplent nos intestins. Ce peuple de microbes appelé microbiote nous aide à assimiler les aliments, nous protège de nombreuses maladies et nous fait nous sentir mieux.

L'intestin n'est pas le seul à travailler sur la digestion des aliments pour l'organisme: une population de microbes qui exerce des activités métaboliques et nutritionnelles, a une fonction protectrice et stimule la réponse immunitaire face aux attaques d'agents pathogènes résidents ou arrivés de l'extérieur. Tous les micro-organismes de l'intestin, en partie autochtones et en partie d'origine environnementale, font partie du soi-disant microbiote , c'est-à-dire l'ensemble de tous les microbes qui vivent à l'intérieur et à la surface de notre corps: leur nombre est égal à 10 fois celui de nos cellules, qui sont environ 10 billions.

Le microbiote dit intestinal est présent dans l' intestin humain , un sous-ensemble du microbiote plus général, mais certainement le plus riche et le plus important. Il pèse environ 1 kilogramme et demi et est composé d'environ 500 espèces différentes de bactéries, réparties en 45 genres et 14 familles: certaines sont très utiles, telles que Bacteroides thetaiotaomicron, qui augmente considérablement la capacité du corps à métaboliser les glucides, d'autres à la place ils peuvent devenir nocifs, comme le Clostridium difficile, dont l'action est généralement provoquée par la présence d'autres microbes, mais qui dans certains cas peut provoquer des diarrhées et de la fièvre.

La population de "bons" microbes de l'intestin (qui sont la grande majorité), entre autres, protège l'hôte, c'est-à-dire l'homme, en produisant le mucus qui agit comme une barrière entre les micro-organismes et les cellules qui forment les parois de l'intestin. 'intestin. Il stimule également la réponse inflammatoire et les défenses immunitaires en cas d'attaque de notre corps.

Pour ces raisons, le microbiome est devenu un domaine extrêmement intéressant pour tous les médicaments, car contrairement à certains facteurs qui ne sont pas modifiables et qui affectent l'apparition de maladies - comme l'âge et la génétique - il est possible de modifier le microbiome. Du moins en théorie.

En 2010, une étude réalisée par des chercheurs de l'hôpital Meyer et du Département de pharmacologie de l'Université de Florence a révélé que certains enfants du Burkina Faso, habitués à une alimentation presque végétarienne riche en fibres, ont une population de microbes beaucoup plus riches et plus variés que ceux contenus dans les intestins des pairs florentins, habitués à manger des sucres, des graisses, de la viande et beaucoup moins de fibres. Et que les premiers souffrent beaucoup moins que les seconds de maladies auto-immunes non transmissibles.

Éteint pour toujours. La découverte de chercheurs florentins et d'autres scientifiques qui étudient le microbiote intestinal (et son génome, appelé le microbiome), démontrerait également qu'il existe une corrélation étroite entre ce que nous mangeons, les microbes qui habitent l'intestin et notre état de santé. . Une alimentation riche en fibres, similaire à celle des enfants du Burkina Faso, est certainement plus proche de celle de l'homme: avant l'ère industrielle, en effet, notre espèce était nourrie depuis des millénaires de plantes et de (petit) gibier .

Ce type de régime donnerait lieu à une plus grande biodiversité du microbiote: dans l'intestin des populations "indigènes" encore présentes sur la planète, 50 pour cent plus d'espèces de microbes ont été trouvées que celles contenues dans l'abdomen des Nord-Américains et des Européens . Serait-il alors suffisant de changer de régime et de commencer à manger des aliments riches en fibres (légumineuses, grains entiers, fruits, légumes) pour repeupler nos intestins des espèces perdues? Ce n'est pas exactement comme ça: un changement de style de vie stimule l'enrichissement du microbiote, en quantité et diversité de microorganismes, mais n'est pas en mesure de nous faire récupérer des espèces qui n'étaient pas déjà présentes dans notre organisme à la naissance.

Grâce à une expérience menée sur des souris et réalisée au laboratoire Sonnenburg de l'Université de Stanford, il a en effet été vérifié que les microbes qui ont disparu de l'intestin de la mère à cause d'un régime "occidental" sont définitivement éteints dans l'intestin de l'enfant immédiatement après accouchement. En effet, de nombreux micro-organismes passent au nouveau-né par contact avec la peau, les mamelons et les lèvres de la mère. Et si la mère ne les possède pas, la transmission ne peut avoir lieu.

Transplantation de microbes. D'autres facteurs qui ont contribué au progrès auraient contribué à ce processus d'extinction microbienne chez l'homme occidental: par exemple, l'urbanisation et donc la suppression des terres agricoles et du bétail (fournisseurs d'une plus grande variété de micro-organismes), et l l'utilisation d'antibiotiques, qui peuvent tuer une grande partie de la microflore. Des processus aux effets si irréversibles qu'ils font penser à certains scientifiques que la seule méthode possible pour recréer dans l'abdomen des hommes civilisés un microbiote similaire à celui des peuples indigènes (en meilleure santé) est de sauver les microbes menacés d'extinction dans un sorte d'arche biologique de Noé, pour ensuite les replanter artificiellement dans les nouveaux hôtes humains.

L'épuisement du microbiote serait à la base de la récente propagation de pathologies typiques de la société contemporaine, telles que le cancer du côlon, les maladies auto-immunes, mais aussi l'obésité, les pathologies dépressives et les troubles anxieux. Selon les recherches du microbiologiste américain Justin Sonnenburg, lorsque notre alimentation est épuisée en fibres, les bactéries habituées à les métaboliser, ne les trouvant plus disponibles, attaquent le mucus qui protège l'intestin des autres microbes et ces derniers, qui sont entrés en contact avec le les cellules intestinales provoquent une inflammation.

Une inflammation chronique causée par une mauvaise alimentation et l'amincissement consécutif du mucus protecteur déclencherait les pathologies "occidentales" (d'ailleurs, presque totalement inconnues des tribus des mangeurs de fibres). Une alimentation plus frugale, au contraire, stimulerait les bactéries à produire des composés chimiques utiles à l'organisme, comme le butyrate (que l'on retrouve également dans les fromages vieillis), selon les chercheurs capables de nous protéger contre certaines maladies comme la maladie de Chron, grâce à la son pouvoir anti-inflammatoire.

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